本科毕业证有五种，区别如下：
第一种，高中毕业，参加全国统一高考，直接考入本科高校的学生，毕业后拿到的毕业证。这是非常正规的本科毕业证，不管是一本还是二本，还是三本，公办还是民办。值得一提的是，民办高校本科生和公办高校本科生毕业证的区别在于学费不一样，民办高校本科生的学费一般是公办本科生的三倍左右。
第二种，预备役或是军队生。就是指的学生考取了正规的国办或是民办高校的专科，但是保留学籍，去参军了。这样的专科军队生如果再到本科高校学习，有优惠，但是也需要参加考试，这种本科毕业证也是很正规的。
第三种，全日制专科学生通过专升本考试，考上全日制本科。这种学生的毕业证也是正规的，因为也需要填志愿、录取，然后在校学习。
第四种，自学考试本科学生的毕业证。这种必须在拿到本科毕业证书之前，有专科毕业证书。自学考试学生的毕业证，有两个章在上面，一个是自考省委会的，另一个是主考院校的。学位证书和普通本科学生没有差别。
第五种，函授本科毕业证。这种分为函授与业余，也可以参与脱产的学习方式。成人高考还有一种五年一贯制的专升本，读完专科，升入本科，要求不高。这种本科毕业证会有成人高等教育的字样。